Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk4O35493 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk4O35493 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk4O35493 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk4O35493 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms