Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms