Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kpna4O35343 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kpna4O35343 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms