Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Nedd9O35177 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Nedd9O35177 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Nedd9O35177 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Nedd9O35177 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Nedd9O35177 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Nedd9O35177 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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