Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha8O09127 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha8O09127 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha8O09127 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha8O09127 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms