Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flot1O08917 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flot1O08917 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flot1O08917 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flot1O08917 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flot1O08917 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Flot1O08917 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flot1O08917 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Flot1O08917 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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