Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MttpO08601 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MttpO08601 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MttpO08601 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MttpO08601 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MttpO08601 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MttpO08601 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MttpO08601 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MttpO08601 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MttpO08601 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MttpO08601 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MttpO08601 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MttpO08601 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MttpO08601 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MttpO08601 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MttpO08601 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MttpO08601 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MttpO08601 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MttpO08601 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MttpO08601 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MttpO08601 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MttpO08601 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MttpO08601 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MttpO08601 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MttpO08601 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MttpO08601 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MttpO08601 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MttpO08601 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MttpO08601 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MttpO08601 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MttpO08601 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MttpO08601 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MttpO08601 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MttpO08601 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MttpO08601 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MttpO08601 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MttpO08601 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MttpO08601 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MttpO08601 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MttpO08601 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MttpO08601 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MttpO08601 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MttpO08601 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MttpO08601 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MttpO08601 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MttpO08601 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MttpO08601 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MttpO08601 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MttpO08601 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MttpO08601 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MttpO08601 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MttpO08601 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MttpO08601 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MttpO08601 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MttpO08601 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MttpO08601 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MttpO08601 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MttpO08601 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MttpO08601 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MttpO08601 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MttpO08601 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MttpO08601 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms