Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al1oL7MU04 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al1oL7MU04 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1oL7MU04 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms