Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34bJ3QNR8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim34bJ3QNR8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim34bJ3QNR8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim34bJ3QNR8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms