Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3415J3QMS8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3415J3QMS8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3415J3QMS8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3415J3QMS8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3415J3QMS8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3415J3QMS8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3415J3QMS8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3415J3QMS8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3415J3QMS8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3415J3QMS8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3415J3QMS8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3415J3QMS8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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