Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms