Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms