Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pot1bH7BX60 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms