Protein–RNA interactions for Protein: G3X9P6

Obox5, MCG4771, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox5G3X9P6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox5G3X9P6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Obox5G3X9P6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms