Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfgef1G3X9K3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms