Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc9a3G3X939 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc9a3G3X939 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc9a3G3X939 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc9a3G3X939 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc9a3G3X939 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc9a3G3X939 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc9a3G3X939 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc9a3G3X939 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms