Protein–RNA interactions for Protein: G3UYY4

Ttc6, Tetratricopeptide repeat domain 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc6G3UYY4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc6G3UYY4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc6G3UYY4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc6G3UYY4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc6G3UYY4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc6G3UYY4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc6G3UYY4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc6G3UYY4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc6G3UYY4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc6G3UYY4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc6G3UYY4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc6G3UYY4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc6G3UYY4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 594.8 ms