Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms