Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP0

Zfp708, Zinc finger protein 708, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp708F8VPP0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp708F8VPP0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp708F8VPP0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms