Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933403O08RikF6UK53 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933403O08RikF6UK53 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4933403O08RikF6UK53 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933403O08RikF6UK53 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933403O08RikF6UK53 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933403O08RikF6UK53 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933403O08RikF6UK53 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933403O08RikF6UK53 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms