Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sptbn5F6UCX4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptbn5F6UCX4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms