Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M11F6U8V3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M11F6U8V3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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