Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prl3d2F6R3P9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms