Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A430078G23RikE9Q7Y4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430078G23RikE9Q7Y4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430078G23RikE9Q7Y4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms