Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm5407E9Q7Q1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Gm5407E9Q7Q1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Gm5407E9Q7Q1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Gm5407E9Q7Q1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Gm5407E9Q7Q1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Gm5407E9Q7Q1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Gm5407E9Q7Q1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5407E9Q7Q1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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