Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Urb2E9Q7L1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Urb2E9Q7L1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms