Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r56E9Q4U5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms