Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde8bE9Q4S1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde8bE9Q4S1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms