Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd1E9Q3H4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms