Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tarbp1E9Q368 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tarbp1E9Q368 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms