Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Pdzd2E9Q1M1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Pdzd2E9Q1M1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd2E9Q1M1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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