Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E430018J23RikE9PZQ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E430018J23RikE9PZQ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms