Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Scaf11E9PZM7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf11E9PZM7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scaf11E9PZM7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms