Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd1E9PZ26 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms