Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcdh10E9PXQ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pcdh10E9PXQ7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcdh10E9PXQ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcdh10E9PXQ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms