Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms