Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms