Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl3E0CZ16 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms