Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC035044E0CXF8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BC035044E0CXF8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC035044E0CXF8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC035044E0CXF8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC035044E0CXF8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC035044E0CXF8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC035044E0CXF8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC035044E0CXF8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC035044E0CXF8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC035044E0CXF8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC035044E0CXF8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms