Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930455H04RikD3Z622 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930455H04RikD3Z622 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms