Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp6ap1lD3Z5W0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp6ap1lD3Z5W0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp6ap1lD3Z5W0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp6ap1lD3Z5W0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp6ap1lD3Z5W0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms