Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif28pD3YXS5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms