Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SafbD3YXK2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SafbD3YXK2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SafbD3YXK2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms