Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17333C6EQI3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17333C6EQI3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms