Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf1bB9EJ57 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf1bB9EJ57 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf1bB9EJ57 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf1bB9EJ57 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf1bB9EJ57 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms