Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf3B2RUQ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf3B2RUQ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 381.3 ms