Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms