Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt4B2RU40 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms