Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc22a28B2RT89 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms