Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Ythdc2B2RR83 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ythdc2B2RR83 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms